漆黑的夜晚，一名間諜悄然潛入日本警方某機構(gòu)，盜走了記載著各國諜報機構(gòu)重要數(shù)據(jù)的絕密文件的絕密數(shù)據(jù)。日本警方和FBI探員赤井秀一（池田秀一配音）旋即與間諜展開追逐。最后，逃亡者的車輛墜落懸崖。第二天，柯南（高山南配音）和伙伴們來到東都水族館觀光，結(jié)果發(fā)現(xiàn)一名受傷的美麗女子（天海佑希配音）。該女子處于失憶狀態(tài)，身上的手機也破損無法使用。柯南等人答應(yīng)要幫她恢復記憶，當他們七嘴八舌之際，藏在暗處的黑衣組織成員貝爾摩德（小山茉美配音）冷冷地注視著這一切。在相處過程中，女子非凡的身手和奇怪的言行舉止讓灰原哀（林原惠美
殷商末年，東海大將夜叉密謀篡權(quán)，企圖暗害龍王之女以達成他統(tǒng)治東海的目的。不料其陰謀被陳塘關(guān)總兵李靖之子哪吒無意撞到。為了掩人耳目，夜叉將暗害龍女的罪名嫁禍給哪吒，將其變?yōu)辇堊宓墓珨场６诹硗庖环剑倪甘芄窒商艺嫒酥巴鸸舛葱薜溃局杏龅搅嗽庥鲆共姘岛Χビ洃浀凝埮约熬ㄗ兓投莸刂g(shù)的土行孫，三人都被太乙真人收為門徒。就在哪吒一行人潛習法術(shù)之時，夜叉卻率龍宮重兵來到了陳塘關(guān)，大戰(zhàn)一觸即發(fā)。
在遠離大都會的小山村，住著巫女世家出身的高中女孩宮水三葉（上白石萌音配音）。校園和家庭的原因本就讓她充滿煩惱，而近一段時間發(fā)生的奇怪事件，又讓三葉摸不清頭腦。不知從何時起，三葉在夢中就會變成一個住在東